Apakah varian COVID Mutan Ganda Dibalik Lonjakan Rekor Kasus di India?

CakapCakap – Cakap People! Dengan penghitungan harian infeksi COVID-19 di India melonjak, para ahli kesehatan masyarakat khawatir bahwa varian baru virus corona – yang mungkin lebih ganas – bisa terjadi di negara dengan populasi terpadat kedua di dunia dengan lebih dari 1,3 miliar orang itu.

Al Jazeera melaporkan, varian baru, yang disebut mutan ganda, diperkirakan memicu gelombang baru kasus mematikan di India yang menjadikannya negara terparah kedua di dunia, melampaui Brasil lagi. Lonjakan kasus itu telah mulai membanjiri rumah sakit dan krematorium. India telah melaporkan lebih dari 14,5 juta kasus COVID sejauh ini dan lebih dari 175.600 kematian.

“Ini adalah variant of interest yang kami ikuti,” kata Maria Van Kerkhove, pimpinan teknis Organisasi Kesehatan Dunia (WHO) tentang COVID, kepada wartawan, Jumat, 16 April 2021.

“Memiliki dua dari mutasi ini, yang telah terlihat pada varian lain di seluruh dunia, mengkhawatirkan,” katanya, seraya menambahkan bahwa ada kemiripan dengan mutasi yang meningkatkan penularan serta mengurangi netralisasi, mungkin menghambat kemampuan vaksin untuk mengekang virus.

Strain baru menggarisbawahi sifat berbahaya dari virus dan mengancam untuk menggagalkan upaya pengendalian di India, meskipun ada tindakan seperti penguncian terbesar di dunia tahun lalu. Wabah yang meledak di India berisiko membatalkan kemenangan yang diraih dengan susah payah atas patogen bagi orang lain, juga, terutama karena strain ini sekarang telah melonjak ke setidaknya 10 negara lain.

Inilah yang kami ketahui sejauh ini:

Bagaimana munculnya varian “mutasi ganda”?

Varian baru, yang disebut B.1.617, awalnya terdeteksi di India dengan dua mutasi – E484Q dan L452R. Ini pertama kali dilaporkan akhir tahun lalu oleh seorang ilmuwan di India dan rincian lebih lanjut disajikan di hadapan WHO pada hari Senin, menurut Van Kerkhove.

Virus bermutasi sepanjang waktu, sebagai bagian dari biologi evolusi. Beberapa mutasi melemahkan virus sementara yang lain mungkin membuatnya lebih kuat, memungkinkannya berkembang biak lebih cepat atau menyebabkan lebih banyak infeksi.

Kementerian kesehatan India pertama kali mengakui keberadaan “mutan ganda” pada akhir Maret, tetapi sejak itu meremehkannya. Meskipun merupakan varian yang menarik, tapi “belum dicap sebagai ‘variant of interest‘ sehingga dikatakan lebih mematikan atau lebih menular,” Aparna Mukherjee, seorang ilmuwan di Dewan Riset Medis India, yang bekerja di bawah kementerian kesehatan negara, kepada Bloomberg TV pada hari Jumat.

Mutasi ganda telah ditemukan di beberapa negara seperti Australia, Belgia, Jerman, Irlandia, Namibia, Selandia Baru, Singapura, Inggris dan AS, menurut pernyataan pemerintah India pada 16 April. “Transmisibilitas yang lebih tinggi dari varian ini belum ditetapkan,” katanya.

Apakah itu menyebabkan rekor lonjakan infeksi di India?

Pengurutan genom menunjukkan varian sebagai kemungkinan penyebabnya, meskipun pemerintah India belum mengonfirmasinya.

Prevalensi rata-rata varian melonjak hingga 52% dari sampel yang diurutkan pada bulan April dari hampir tidak ada di bulan Januari, menurut situs pelacak outbreak.info, yang menggunakan data dari repositori global GISAID.

Di beberapa distrik di negara bagian Maharashtra – rumah bagi Mumbai dan episentrum gelombang saat ini yang memicu pemberlakuan penguncian baru – prevalensi varian ini lebih dari 60%, menurut Anurag Agrawal, direktur Dewan Ilmiah dan Lembaga genomik Riset Industri yang melakukan pengurutan.

B.1.617 terdapat dalam sampel dari sekitar 10 negara bagian India dan sementara persentasenya dapat bervariasi, di mana ini diperkirakan akan meningkat karena “ia memiliki dua mutasi kritis yang membuatnya lebih mungkin untuk menularkan dan melarikan diri dari kekebalan sebelumnya,” kata Agrawal.

Kedua mutasi diketahui mengurangi – meskipun tidak sepenuhnya menghilangkan – pengikatan antibodi yang diciptakan oleh infeksi dan vaksinasi, menurut Jesse Bloom, seorang profesor ilmu genom dan mikrobiologi di Universitas Washington.

“Mutasi di situs E484 dan L452 telah diamati secara terpisah, tetapi ini adalah garis keturunan virus utama pertama yang menggabungkan keduanya,” kata Bloom. “Menurut saya varian virus baru ini penting untuk dipantau.”

“Kami menghitungnya – kami yakin bahwa banyak peningkatan jumlah reproduksi dapat dijelaskan oleh mutasi ini,” Nithya Balasubramanian, kepala penelitian perawatan kesehatan di Bernstein India, mengatakan kepada Bloomberg TV minggu ini. Jadi, ya, mutasi adalah penyebab besar kekhawatiran.

Ketidakpatuhan terhadap jarak fisik, pemakaian masker dan tindakan kesehatan masyarakat lainnya mungkin juga telah berkontribusi pada lonjakan saat ini, menurut Stephen Goldstein, seorang peneliti dalam virologi evolusioner di Universitas Utah.

“Sulit untuk mengatakan apakah ada varian tertentu yang bertanggung jawab tanpa pekerjaan epidemiologis yang cukup ketat,” katanya, seraya menambahkan bahwa para ilmuwan akan membutuhkan sekuensing genom pada sampel yang mewakili virus untuk mengetahui persentase kasus di India yang terinfeksi varian ini.

Setelah puas dalam memetakan genom virus dalam beberapa bulan terakhir – India melakukan pengurutan untuk kurang dari 1% sampel positif pada bulan lalu – negara itu sekarang berjuang untuk menutupi tanah yang hilang. “Kami berusaha untuk melakukan setidaknya 5% dari sampel apa pun yang ada,” kata Mukherjee dari ICMR.

“Sepertinya virus itu menyebar lebih cepat daripada varian yang sudah ada sebelumnya,” kata Rakesh Mishra, direktur Center for Cellular and Molecular Biology yang berbasis di Hyderabad – laboratorium lain di India yang melakukan pengurutan genom sampel COVID. “Cepat atau lambat, ini akan menjadi umum di seluruh negeri, mengingat cara penyebarannya.”

Apakah ditemukan di luar India?

Varian mutasi ganda ini telah terdeteksi di setidaknya 10 negara lain, termasuk AS, Inggris, Australia, dan Selandia Baru, menurut laporan situasi di outbreak.info.

Pada 16 April, 408 urutan dalam garis keturunan B.1.617 telah terdeteksi dan 265 di antaranya ditemukan di India, laporan tersebut menunjukkan. Sebuah laporan pengawasan oleh pemerintah Inggris mengatakan telah menemukan 77 kasus di Inggris dan Skotlandia sejauh ini, menyebutnya sebagai “Variant Under Investigation.”

Apakah itu lebih mematikan dari varian lain di luar sana?

Peneliti masih mencoba mencari tahu. Fitur varian mutan ganda sedang diselidiki, tetapi mutasi L452R dicirikan dengan baik dalam penelitian AS, menurut Agrawal. Ini meningkatkan transmisi virus sekitar 20% dan mengurangi kemanjuran antibodi lebih dari 50%, katanya.

Secara global, tiga varian mengkhawatirkan yang sejauh ini muncul di Inggris, Afrika Selatan, dan Brasil telah menimbulkan kekhawatiran khusus. Penelitian menunjukkan bahwa virus lebih menular, dan beberapa bukti menunjukkan salah satunya lebih mematikan sementara yang lain mendorong infeksi ulang.

Strain mutan ganda ini, pertama kali ditemukan di India, telah mulai mengganggu ahli virus di mana-mana.

“Varian B.1.617 memiliki semua ciri khas virus yang sangat berbahaya,” William A. Haseltine, mantan profesor di Harvard Medical School menulis di Forbes pada 12 April. “Kita harus melakukan semua yang mungkin untuk mengidentifikasi penyebarannya dan untuk menahannya. “

Apakah vaksin bekerja melawannya?

Sulit untuk mengetahui secara pasti tanpa data dan penelitian yang memadai. India sedang menguji apakah varian baru, termasuk B.1.617, mampu “lolos dari kekebalan atau tidak,” menurut Mukherjee dari ICMR.

Immune escape mengacu pada kemampuan patogen untuk menghindari respons kekebalan tubuh manusia. Ini berarti antibodi yang dibuat setelah vaksinasi atau infeksi sebelumnya mungkin tidak melindungi seseorang dari infeksi. Jika varian baru India menunjukkan perilaku “immune escape”, ini akan memiliki konsekuensi yang dalam untuk program vaksinasi India, yang telah meningkat setelah awal yang lambat dan sejauh ini memberikan hampir 120 juta dosis.
India saat ini telah memberikan persetujuan penggunaan darurat tiga vaksin.

Dua di antaranya sudah digunakan sementara yang ketiga, Sputnik V Rusia, telah disetujui minggu ini. India juga mempercepat persetujuan untuk vaksin asing minggu ini. Semua upaya ini berisiko terancam jika suntikan vaksin menjadi kurang efektif terhadap varian mutasi ganda ini.

“Itu adalah salah satu yang ada di radar kami, dan dengan melakukan itu, itu berarti ada di radar orang-orang di seluruh dunia,” kata Van Kerkhove.