Virus Corona Penyebab Penyakit COVID-19 Sudah Bermutasi Lebih dari 6.600 Kali

CakapCakap – Cakap People! Virus Sars-CoV-2 yang memicu pandemi COVID-19 telah mengalami lebih dari 6.600 mutasi protein lonjakan yang unik. Demikian kata Dr Sebastian Maurer-Stroh, direktur eksekutif Institut Bioinformatika di Agency for Science, Technology and Research (A *Star).

Melansir The Straits Times, virus bermutasi setiap kali ada “kesalahan” dalam proses replikasi. Ini bisa terjadi akibat penambahan, penghapusan, atau perubahan kode genetiknya.

Jika kesalahan itu meningkatkan prospek kelangsungan hidupnya, lebih banyak salinan dari replikasi yang “salah” itu akan bertahan, dan terkadang membanjiri versi aslinya.

Misalnya, mutasi D614G yang mulai meningkat tajam pada Februari tahun lalu kini ditemukan di semua sampel virus, apapun variannya.

Karena varian ini menjadi begitu menyebar, ia diberi nama klade – atau grup keluarga – sendiri, dan ditetapkan sebagai klade G.

Organisasi Kesehatan Dunia (WHO) mengatakan bahwa sementara klade G telah meningkatkan infektivitas dan penularan, penyakit yang ditimbulkannya tidak lebih parah, juga tidak mempengaruhi diagnosis, pengobatan atau vaksin.

Klade G ini dan sub kladenya – yang mencakup GRY, klade yang dinamai untuk varian Inggris B117 pada Juli tahun lalu – telah menyebabkan hampir semua infeksi COVID-19 sejak pertengahan tahun lalu, benar-benar menggantikan virus asli yang muncul di Wuhan.

Jadi jika ada begitu banyak mutasi virus, mengapa WHO hanya mencantumkan tiga varian mutasi “concern” sejauh ini, dan segelintir varian “interest“, dan secara praktis mengabaikan sisanya?

Untuk memenuhi syarat sebagai variant of concern (VOC), virus yang bermutasi harus menunjukkan bukti dalam memenuhi setidaknya satu dari kriteria berikut: lebih mudah menular, menyebabkan penyakit yang lebih parah, secara signifikan mengurangi netralisasi oleh antibodi, atau mengurangi efektivitas pengobatan, vaksin atau diagnosis.

Maurer-Stroh menjelaskan bahwa tidak semua mutasi membuat perbedaan pada penyakit dengan cara-cara ini. Karenanya, mutasi ini tidak membuat gelombang.

Varian biasanya terdiri dari lima hingga 15 mutasi yang, bersama-sama, memberi mereka keuntungan tambahan.

Dr Maurer-Stroh mengatakan istilah varian “mutan ganda” atau “mutan tiga kali lipat” yang digunakan untuk menggambarkan galur virus yang mengamuk di India adalah keliru, tetapi secara luas merujuk pada mutasi yang lebih signifikan yang ditemukan pada varian tersebut.

Untungnya, saat ini hanya ada tiga VOC.

Namun, ada beberapa variant of interesting (VOI) yang tampaknya menunjukkan beberapa karakteristik VOC, tetapi untuk saat ini tidak cukup bukti. Itu mungkin berubah.

Mereka termasuk dua varian yang pertama kali terdeteksi di India yang menyebabkan lonjakan besar kasus selama sebulan terakhir.

Terlepas dari jumlah kasus dan kematian yang terus meningkat di India – 22 juta kasus dan lebih dari 235.000 kematian – WHO belum mengklasifikasikan mereka sebagai VOC karena masih ada ketidakpastian mengenai seberapa banyak penyebaran COVID-19 di sana yang disebabkan oleh varian dan berapa banyak yang disebabkan oleh faktor lain seperti tindakan keamanan yang buruk dan kapasitas rumah sakit yang tidak mencukupi.

Ada lebih dari 6.600 mutasi unik pada protein lonjakan virus corona sejak muncul pada Desember 2019, kata Dr Maurer-Stroh, yang terlibat dalam mengumpulkan dan menganalisis perubahan genom virus di bawah platform berbagi data Gisaid, yang telah membagikan lebih dari 1,5 juta urutan virus secara global.

Virus itu menghasilkan satu mutasi unik setiap dua jam, siang atau malam.

Apakah vaksin yang tersedia saat ini untuk digunakan melawan varian-varian ini?

Pastinya, kata Profesor Ooi Eng Eong dari Sekolah Kedokteran Duke-NUS, yang juga terlibat dalam pengembangan vaksin mRNA. Dia berkata: “Studi di antara individu yang divaksinasi telah menemukan bahwa vaksin mRNA juga mampu mencegah infeksi dari berbagai varian yang menjadi perhatian.

“Setidaknya empat laporan telah menunjukkan bahwa tingkat terobosan varian gejala infeksi Sars-CoV-2 telah di bawah 1 persen di antara individu yang divaksinasi.”

Antibodi yang dihasilkan oleh vaksin mengenali bagian dari lonjakan virus. Kekhawatirannya adalah jika bagian yang diakui vaksin diubah, apakah masih dapat melindungi orang yang telah divaksinasi?

Prof Ooi menjelaskan bahwa vaksin tidak hanya menghasilkan antibodi, tetapi juga “mengaktifkan serangkaian respons imun” di dalam tubuh, termasuk produksi sel T yang membunuh virus dan sel yang terinfeksi. Ini tidak akan terpengaruh oleh perubahan protein lonjakan.

Namun, Associate Professor Hsu Liyang, seorang ahli penyakit menular di Sekolah Kesehatan Masyarakat Saw Swee Hock di National University Singapore, menambahkan peringatan tentang asumsi bahwa vaksin saat ini akan tetap melindungi.

Apa yang berlaku saat ini mungkin tidak selalu demikian, katanya. “Kami tidak memperkirakan virus tetap diam. Akan ada lebih banyak varian yang muncul.”